前言
孤立森林,一种非常高效快速的异常检测算法
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scikit-learn
- import numpy as np
- import matplotlib.pyplot as plt
- from sklearn.ensemble import IsolationForest
- rng = np.random.RandomState(0)
- X_train = 0.3 * rng.randn(100, 2)
- X_outliers = rng.uniform(low=-2, high=2, size=(10, 2))
- clf = IsolationForest(n_estimators=100, max_samples='auto', contamination='auto', random_state=rng)
- clf.fit(X_train)
- y_pred_train = clf.predict(X_train)
- y_pred_outliers = clf.predict(X_outliers)
- plt.title("Isolation Forest")
- plt.scatter(X_train[:, 0], X_train[:, 1], color='b', label="Normal")
- plt.scatter(X_outliers[:, 0], X_outliers[:, 1], color='r', label="Outliers")
- plt.legend()
- plt.axis('tight')
- plt.show()
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深入理解
类似于随机森林,但每棵树不使用信息增益或基尼系数等指标,而是随机选择一个特征,在该特征的最小值和最大值之间随机选一个切分值,将数据集分成两部分,又在每个部分随机最大值与最小值之间随机选一个切分支,不断递归。指导到达指定深度或者当前节点只有1个样本
构造如此的树n棵,组成森林,开始计算每个样本在每棵树的平均路径长度(叶子节点的深度depth),计算异常分数
\[\begin{cases}c(n)=2H(n-1)-\frac{2(n-1)}{n} \\H(n)=\sum_{i=1}^{n} \frac{1}{i} \\s(x,n) = 2^{-\frac{E(x)}{c(n)}}\end{cases}\]
- \(s \approx 1\),强异常点,很容易被孤立
- \(0.5 \le s < 1\),可能是异常点,越接近1越是异常点,需要配合其他参数来确定,比如异常点比例
- \(s < 0.5\),正常点
举例说明
假设有以下样本: [1, 1.5, 1.8, 2.0, 2.3, 10]
构造第一棵树:
1)第一层:depth=1,随机选择划分值:1 < split < 10 的区间中选择 split = 5
- 左子树:[1, 1.5, 1.8, 2.0, 2.3]
- 右子树:[10.0]
2)第二层:depth=2,随机选择划分值:1 < split < 2.3 的区间中选择 split = 1.6
- 左子树:[1, 1.5]
- 右子树:[1.8, 2.0, 2.3]
3)第三层:depth=3,左子树,随机选择划分值:1 < split < 1.5 的区间中选择 split = 1.2
4)第三层:depth=3,右子树,随机选择划分值:1.8 < split < 2.3 的区间中选择 split = 2.1
5)第四层:depth=4,随机选择划分值:1.8 < split < 2.9 的区间中选择 split = 1.9
6)计算路径
样本值路径长度1.031.531.842.042.3310.01重复构造第n棵树,得出路径,计算路径平均值
样本值第1棵树路径第2棵树路径第n棵树路径平均路径1.033..31.533..31.844..42.044..42.333..310.011..1计算异常得分
\[s(x,n) = 2^{-\frac{E(x)}{c(n)}}\]
1)计算样本(1.0):
- 样本长度:\(E(x) = 3\)
- 样本规模 \(n=6\) 的平均路径期望:
\[\begin{cases}c(n)=2H(n-1)-\frac{2(n-1)}{n} \\H(n)=\sum_{i=1}^{n} \frac{1}{i}\end{cases}\]
\[c(6)=2H(n-1)-\frac{2(n-1)}{n}=2·(1+\frac{1}{2}+\frac{1}{3}+\frac{1}{4}+\frac{1}{5}) - \frac{2(6-1)}{6} \approx 2.8999\]
\[s(1.0) = 2^{-\frac{E(x)}{c(n)}} = 2^{-\frac{3}{2.8999}} \approx 0.4882\]
2)计算所有样本
样本值平均长度异常得分1.030.48821.530.48821.840.38442.040.38442.330.488210.010.7874判断异常点:
- 路径长度越短的越异常,比如10.0的路径长度为1,在第一次分割的时候就被孤立了
- 异常分数越高就是异常点
sklearn中的异常分数
- from sklearn.ensemble import IsolationForest
- import numpy as np
- X = np.array([[1], [1.5], [1.8], [2], [2.3], [10]])
- clf = IsolationForest(random_state=0, contamination='auto')
- clf.fit(X)
- pred = clf.predict(X)
- score = clf.decision_function(X)
- for x, p, s in zip(X, pred, score):
- print(f"样本 {x[0]:>4} -> {'异常' if p==-1 else '正常'} | 异常分数(decision_function): {s:.4f}")
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问题出现了:
- sklearn的分数和手工计算的并不一样
- 为什么1.0被当成异常了
- 分数越小反而越异常
先看第一个问题,sklearn的分数和手工计算的并不一样。首先,每棵树是采用部分的样本来计算,而不是采用所有的样本n=6来计算的。其次,在上面的手工计算中,期望路径长度\(c(n)\)中的\(H(n)\),并不是由这个公式计算的
\[\begin{cases}c(n)=2H(n-1)-\frac{2(n-1)}{n} \\H(n)=\sum_{i=1}^{n} \frac{1}{i}\end{cases}\]
这个公式一旦n的数量增大,\(H(n)\)的计算将会带来很大的计算消耗,通常使用另外一个公式计算近似值:
\[H(n) \approx ln(n) + \gamma ,其中\gamma \approx 0.5772(欧拉常数)\]
以上两点原因,带来的就是sklearn计算异常分数与手工计算不一样
再看第二个问题,为什么1.0被当成异常了
只需要调整一个参数,contamination=0.1就可以解决这个问题了
contamination用来调节异常比例的参数,如果是auto,那么异常比例为33.3%,6个样本,那么异常点就是2个。手动调整为0.1,那就告诉模型只有1个异常点,那么最不正常的就是10.0了
最后第三个问题,分数越小反而越异常。这明显是计算方式不一样造成的,这里直接解析一下源码,版本:scikit-learn:1.6.1:
- decision_function函数
- def decision_function(self, X):
- return self.score_samples(X) - self.offset_
复制代码 - score_samples函数返回的是:经过公式\(s(x,n) = 2^{-\frac{E(x)}{c(n)}}\)计算的相反数
- def score_samples(self, X):
- ...
- return self._score_samples(X)
- def _score_samples(self, X):
- return -self._compute_chunked_score_samples(X)
- def _compute_chunked_score_samples(self, X):
- ...
- for sl in slices:
- # compute score on the slices of test samples:
- scores[sl] = self._compute_score_samples(X[sl], subsample_features)
- return scores
- def _compute_score_samples(self, X, subsample_features):
- ...
- scores = 2 ** (
- # For a single training sample, denominator and depth are 0.
- # Therefore, we set the score manually to 1.
- -np.divide(
- depths, denominator, out=np.ones_like(depths), where=denominator != 0
- )
- )
- return scores
复制代码 - self.offset_是根据整个样本异常分数,再加上异常比例参数contamination的中位数计算出来的
- self.offset_ = np.percentile(self._score_samples(X), 100.0 * self.contamination)
复制代码 看到这里,我就想说,复杂就行了,经过这么复杂的计算,与手动计算出来的肯定不一样
小结
在sklearn中
- 找到孤立点,contamination是一个非常重要的参数,它决定了每个节点的分数以及后续确定是否异常
- 快速找到孤立点,直接通过pred函数即可,-1是孤立点,1是正常点
- 想要获取点的评分,通过decision_function函数获取评分,与理论公式不同,评分越低反而越异常
小结
至此,本文结束
在下才疏学浅,有撒汤漏水的,请各位不吝赐教...
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